在认证审核时，会对组织身份的合法性进行检查，即证照检查，包括营业执照、生产许可证等。

主要检查是否有，是否在有效期内、是否进行了年检、体系认证覆盖产品范围是否在证照限定范围内。

目前国家要求实行生产许可证管理的共32个大类的食品，在审核时，首先会确认体系覆盖产品是否在32个大类

关于执行标准主要关注两个地方，一是否有标准，二标准是否有效。

食品行业组织应执行的国家强制性标准主要包括以下几类：

（1）产品标准类

（2）与产品直接接触的包装物标准

（3）标签标准

（4）工厂卫生规范等

对执行企标的企业建议尽量做到以下几点：

原料的管控主要关注原料采购有无标准、进货检验/验证的符合性等，是否有无非食品级原料的使用，以及偷梁换柱的情况。

辅料应特别关注的是食品添加剂和食品营养强化剂的使用是否合法，即有无超范围、超量使用的情况。食品添加剂、食品营养强化剂、食品生产用水的使用应分别符合GB2760、GB14880和 GB5749的规定。

检验指标应至少覆盖适用的产品质量标准和卫生标准；除企业自检报告外，还会关注到政府主管部门的抽检报告。